Elisa (Sally Hawkins), una joven muda y conserje en un laboratorio experimental secreto del gobierno, se enamora de una criatura fantástica de la Amazonía, mitad anfibio y con forma humana, que vive encerrada en un tanque de agua. Para rescatarlo, ella elabora un riesgoso plan con la ayuda de su vecino (Richard Jenkins) y su colega Zelda (Octavia Spencer). ¿Logrará liberarlo?